Да, можно.
Если вы продвигаете объявления вручную в личном кабинете, то можете выбрать — списать продвижение из пакета или оплатить отдельно, без пакета.
Если вы продвигаете объявления с помощью XML-фидов и у вас есть купленный пакет, оплатить объявления вне пакета не получится. Продвижение будет происходить в рамках пакета.